Deputi 4 untuk melaksakan salah satu fungsi pengawasan sebagai internal auditor adalah melakukan audit. Oleh karenanya Deputi 4 juga menghasilkan produk-produk yang menjadi pedoman untuk melakukan audit. Produk-produk tersebut sebagai berikut :

1. Pedoman Audit Dana Tugas Pembantuan
2. Pedoman Audit Keuangan Dana Otsus
3. Pedoman Audit Optimalisasi Pemanfaatan Gedung/Kantor dan Tanah Milik Negara( BM/KN)
4. Pedoman Audit dana Bantuan Parpol
5. Pedoman Reviu LHA Audit Barang dan Jasa Daerah APIP
6. Pedoman Audit Dana Dekonsentrasi
7. Penyusunan Pedoman Audit Kinerja Pemda
8. Pedoman Monitoring Dana Alokasi Khusus (DAK)
9. Pedoman Verifikasi dan Validasi Dana Alokasi Khusus (DAK) dan Dana Penyesuaian Infrastruktur Lainnya (DPIL)