Untuk dapat menjalankan tugas yang telah dibebankan, Perwakilan BPKP Provinsi Kalimantan Utara memiliki Struktur Organisasi dan SDM sebanyak 70 orang sebagai berikut :
| Profil Perwakilan |
| Tugas Pokok dan Fungsi |
| Sekapur Sirih |
| Visi dan Misi |
| Struktur Organisasi dan SDM |
| Wilayah Kerja |
| Informasi Publik |
| Perjanjian Kinerja |
| Indikator Kinerja Utama |
| Laporan Kinerja |
