Untuk dapat menjalankan tugas yang telah dibebankan, Perwakilan BPKP Provinsi Kalimantan Utara memiliki Struktur Organisasi dan SDM sebagai berikut :
| Profil Perwakilan |
| Tugas Pokok dan Fungsi |
| Sekapur Sirih |
| Visi dan Misi |
| Struktur Organisasi dan SDM |
| Wilayah Kerja |